La collection de dessins du musée comprend principalement des études se rapportant aux peintures conservées au musée et au dernier décor réalisé par Delacroix, celui de la chapelle des Saints-Anges à l'église Saint-Sulpice. Des dessins de certains collaborateurs et amis de Delacroix s'y trouvent également (Lassalle-Bordes, Huet, Poterlet, Saint-Marcel, Colin).

Le musée cherche à avoir la totalité de l'œuvre gravé de Delacroix. Il possède les pierres lithographiques pour Hamlet et les gravures correspondantes. Aux gravures dites d'interprétation, s'ajoute un petit nombre de celles représentant Delacroix ou un personnage de son entourage (George Sand, Charles Baudelaire...).